74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4442 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 60 aa  116  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  56.36 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  56.36 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  56.36 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  52.63 
 
 		 54 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 52 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  44.44 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  47.27 
 
 		 53 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  51.79 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  44.64 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  52.08 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  45.76 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  44.07 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  42.37 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  45 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  45.76 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  45.76 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  50.91 
 
 		 58 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  48.21 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  45.76 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  38.33 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  47.92 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  46.55 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  43.33 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  41.07 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4873  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0822533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  42.11 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55940  hypothetical protein  46.3 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  61.29 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  48.08 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  43.1 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  38.6 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  51.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  39.29 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  53.12 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  46.81 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  38.89 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2565  Flp/Fap pilin component  35.71 
 
 		 53 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  38.98 
 
 		 58 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2812  Flp/Fap pilin component  44.23 
 
 		 56 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  40 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2191  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0602  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  40 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3925  Flp/Fap pilin component  36.07 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165585  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  39.62 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0650  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  53.33 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  36.21 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  59.26 
 
 		 61 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>