41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2812 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2812  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 56 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  53.06 
 
 		 54 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  53.06 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2617  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  58.14 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  58.14 
 
 		 53 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  51.02 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  48.84 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  52.38 
 
 		 54 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  40.82 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  44.19 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  40.43 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  44.19 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  44.19 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  42.86 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  42.55 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  38.78 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  46.67 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  43.18 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 61 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  44.23 
 
 		 60 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 54 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  38.64 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  38.64 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  38.64 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  46.51 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 69 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  44.19 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  40.91 
 
 		 60 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  43.48 
 
 		 62 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>