11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2617 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2617  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 60 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2812  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  37.78 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  41.86 
 
 		 53 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  36.73 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  36.73 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  36.96 
 
 		 61 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>