22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55940  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4873  hypothetical protein  91.43 
 
 		 72 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0822533  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4849  hypothetical protein  38.24 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4389  Flp/Fap pilin component  34.43 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  46.67 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  47.62 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  47.62 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  47.62 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  38.98 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3418  Flp/Fap pilin component  45.76 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  44.83 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  60.61 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  58.82 
 
 		 60 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  43.94 
 
 		 55 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 72 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  59.38 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0650  Flp/Fap pilin component  48.65 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3925  Flp/Fap pilin component  44.07 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165585  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  41.54 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>