21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4873 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4873  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  140  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0822533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55940  hypothetical protein  91.43 
 
 		 70 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4849  hypothetical protein  38.24 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4389  Flp/Fap pilin component  34.43 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  45 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  45.16 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0650  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1523  hypothetical protein  47.5 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3418  Flp/Fap pilin component  44.83 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  59.38 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  44.26 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  57.58 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  37.29 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  39.39 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>