18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0650 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0650  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 81 aa  164  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0850  Flp/Fap pilin component  55.36 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4849  hypothetical protein  54.17 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4389  Flp/Fap pilin component  52.08 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  44 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3925  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165585  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4873  hypothetical protein  46.15 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0822533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 58 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 60 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 69 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  43.18 
 
 		 52 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55940  hypothetical protein  48.65 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2164  Flp/Fap pilin component  67.39 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0573489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>