14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0850 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0850  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 59 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0650  Flp/Fap pilin component  55.36 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 55 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  36 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0551  Flp/Fap pilin component  32.65 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.871798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 54 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  36.17 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4389  Flp/Fap pilin component  40.32 
 
 		 68 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>