33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0551 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0551  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 58 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.871798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0660  putative pilin transmembrane protein  81.13 
 
 		 53 aa  88.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.270782  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0661  putative pilin transmembrane protein  79.25 
 
 		 53 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0658  putative pilin transmembrane protein  56 
 
 		 53 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279037  normal  0.470372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  41.38 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  39.66 
 
 		 58 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  35.09 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 57 aa  47.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  34.55 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0659  putative pilin protein  57.78 
 
 		 45 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188771  normal  0.476539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  35.19 
 
 		 58 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  29.82 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  33.96 
 
 		 54 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  35.19 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  36.21 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  28.07 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  23.21 
 
 		 62 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  35.71 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  32.69 
 
 		 53 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2317  Flp/Fap pilin component  38.6 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728903  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0850  Flp/Fap pilin component  32.65 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  33.93 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  33.93 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  33.93 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  34.43 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>