37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2317 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2317  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 63 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728903  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  51.72 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  45 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  64.86 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  64.86 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  64.86 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  46.15 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  57.58 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  51.92 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  41.38 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  44 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  40.98 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  65.52 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  45.61 
 
 		 58 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  54.35 
 
 		 52 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  41.94 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  41.94 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  53.19 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  42.11 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  44 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0303  Flp/Fap pilin component  44.26 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  40.68 
 
 		 61 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  59.38 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0551  Flp/Fap pilin component  38.6 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.871798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0660  putative pilin transmembrane protein  48.65 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.270782  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  44.23 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3825  Flp/Fap pilin component  44 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>