93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1517 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
56 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
56 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
56 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  68.52 
 
 
54 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  63.64 
 
 
72 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  63.64 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  63.64 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  63.64 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  63.64 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  61.82 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  53.57 
 
 
58 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  56.6 
 
 
68 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  49.09 
 
 
58 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  50 
 
 
58 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  48.21 
 
 
58 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  50 
 
 
57 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  49.06 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  50 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  55.1 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  53.85 
 
 
53 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  56.36 
 
 
60 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  48.15 
 
 
54 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  48.15 
 
 
61 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  51.02 
 
 
57 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  47.27 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  48.15 
 
 
54 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  50 
 
 
57 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  52 
 
 
52 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  45.76 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  45.76 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  45.76 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  43.4 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  49.02 
 
 
55 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  41.82 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 
61 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 
55 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 
59 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0660  putative pilin transmembrane protein  45.28 
 
 
53 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.270782  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  44.44 
 
 
58 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  46 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0551  Flp/Fap pilin component  40 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.871798  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2317  Flp/Fap pilin component  64.86 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728903  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0661  putative pilin transmembrane protein  41.51 
 
 
53 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 
58 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 
54 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  47.92 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 
60 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 
54 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1116  Flp/Fap pilin component  56.36 
 
 
58 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  36.36 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 
56 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3709  Flp/Fap pilin component  54.72 
 
 
53 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.815351  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  52.63 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  40.43 
 
 
48 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  40.43 
 
 
48 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55940  hypothetical protein  47.62 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175514  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  40.43 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  50 
 
 
54 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 
56 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3534  Flp/Fap pilin component  42 
 
 
55 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4873  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0822533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0283  Flp/Fap pilin component  51.43 
 
 
54 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.026664  normal  0.0309888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 
70 aa  42  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1115  Flp/Fap pilin component  58.18 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.610115  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 
54 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  39.13 
 
 
72 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2746  Flp/Fap pilin component  52.73 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2745  Flp/Fap pilin component  52.73 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  30.61 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3825  Flp/Fap pilin component  38 
 
 
55 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0304  Flp/Fap pilin component  50 
 
 
55 aa  40.8  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  56.67 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2512  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 
57 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.236986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2565  Flp/Fap pilin component  34 
 
 
53 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3925  Flp/Fap pilin component  37.93 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165585  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  42 
 
 
52 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>