53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2164 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2164  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 61 aa  120  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0573489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0650  Flp/Fap pilin component  64 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4389  Flp/Fap pilin component  58.82 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4849  hypothetical protein  58.7 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  43.1 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  41.82 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  41.82 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  43.4 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  40.68 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  39.29 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  39.29 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  39.29 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  39.29 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  41.38 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  36.21 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  39.29 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  42.86 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 54 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  41.07 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 54 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 52 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  33.93 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  44.07 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  44.07 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  32.79 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55940  hypothetical protein  58.82 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4873  hypothetical protein  58.82 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0822533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0660  putative pilin transmembrane protein  35.85 
 
 		 53 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.270782  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  30.19 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 57 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 56 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3925  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165585  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0850  Flp/Fap pilin component  48.08 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 53 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>