19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2565 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2565  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 53 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2564  Flp/Fap pilin component  96.23 
 
 		 53 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  36.54 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  36.54 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  36.54 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  36.54 
 
 		 58 aa  42  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  35.71 
 
 		 60 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  32 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  34.69 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  34 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  34 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  34 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  32 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  32 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  32 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  32 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>