17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06199 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06199  Flp pilus assembly protein  100 
 
 		 68 aa  135  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0602  Flp/Fap pilin component  46.88 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  41.38 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0366  fimbrial protein, Flp/Fap pilin component  51.28 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00954684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  49.09 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  41.82 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  42.62 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  41.07 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  35.38 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>