28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2545 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2545  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.221854  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0615  Flp/Fap pilin component  42.37 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0603648  normal  0.95811 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  51.11 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  47.06 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  51.11 
 
 		 48 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  51.11 
 
 		 48 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  33.87 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2640  Flp/Fap pilin component  39.29 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  42.86 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 52 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  42.55 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 57 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  43.48 
 
 		 54 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  40.43 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  40.43 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  40.43 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  35 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>