30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2640 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2640  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 74 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  65.22 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  44.68 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  44.68 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  44.68 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  44.68 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  39.29 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  34.29 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2545  Flp/Fap pilin component  39.29 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.221854  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  33.93 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  39.13 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  39.13 
 
 		 72 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  33.96 
 
 		 60 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 58 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 58 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  40 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  40 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  36 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7205  Flp/Fap pilin component  36 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699567  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>