18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2642 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2642  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
71 aa  144  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2634  Flp/Fap pilin component  48.94 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  37.04 
 
 
61 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2633  Flp/Fap pilin component  51.11 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  45.24 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0875  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  32.69 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  36 
 
 
54 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  35.29 
 
 
63 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  35.42 
 
 
63 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  41.86 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  33.93 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  34 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  33.93 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  33.9 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  42.11 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3506  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171468  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>