23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0720 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0720  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
60 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.915545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2182  pilus biosythesis protein-related protein  49.15 
 
 
59 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2094  pilus biosythesis protein-related protein  49.15 
 
 
59 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  39.66 
 
 
61 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  34.48 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  46 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  40 
 
 
56 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  33.93 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  38 
 
 
54 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  40.43 
 
 
52 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  38.98 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  41.86 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 
55 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 
56 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 
54 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  36.17 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 
54 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 
57 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  39.29 
 
 
65 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>