30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0283 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0283  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 54 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.026664  normal  0.0309888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  48 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 56 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  62.5 
 
 		 54 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  57.58 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  46.94 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  57.58 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  54.29 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  56.25 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  51.43 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  53.12 
 
 		 61 aa  42  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  51.43 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  51.43 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  39.53 
 
 		 60 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  48.72 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  45 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  44.44 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  54.29 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  54.29 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  54.29 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 58 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  65.38 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  51.43 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  48.84 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>