110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4514 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 317 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  85.49 
 
 		 317 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  87.38 
 
 		 317 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  85.17 
 
 		 317 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  74.05 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  66.46 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  74.88 
 
 		 247 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  74.88 
 
 		 247 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  47.77 
 
 		 329 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  44.73 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  49.52 
 
 		 318 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  46.96 
 
 		 322 aa  228  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  45.22 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  48.09 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  48.09 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  48.09 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  49.36 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  43.73 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  43.45 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  43.77 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  46.3 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  38.17 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  43.45 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  46.33 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  38.99 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43.46 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  41.99 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  44.3 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  39.03 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  41.26 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  43.04 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  30 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  43.73 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  31.14 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  31.14 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  29.32 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  28.66 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  30.4 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  30.4 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  30.4 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  30.4 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  30.55 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  35.46 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  42.04 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43.53 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  43.01 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  31.01 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  32.51 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  36.15 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  36.13 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  44.79 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  26.26 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  23.22 
 
 		 362 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  22.73 
 
 		 359 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  24.07 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  25.81 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  23.78 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  23.49 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  24.47 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  25.09 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  22.26 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  23.79 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  25.61 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  23.42 
 
 		 389 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  29.61 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  22.91 
 
 		 515 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  22.35 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  22.93 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  22.93 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  23.42 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  24.56 
 
 		 368 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  26.06 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  23.68 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  23.17 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  23.33 
 
 		 354 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  23.68 
 
 		 381 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  21.96 
 
 		 355 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0575  arsenical-resistance protein  27.91 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  24 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  23.68 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  24.67 
 
 		 309 aa  45.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  23.62 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  22.08 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  22.63 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  23.79 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  23.18 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  21.76 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  25.1 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  27.27 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  23.89 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  26.06 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  22.47 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  22.18 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  25.22 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  21.97 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  23.29 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  22.32 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  24.56 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  21.66 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>