50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3671 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
319 aa  595  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  49.2 
 
 
321 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  42.31 
 
 
336 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  47.67 
 
 
332 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  35.03 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  38.05 
 
 
317 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  36.77 
 
 
322 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  33.65 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  38.68 
 
 
317 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  40.74 
 
 
345 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  38.59 
 
 
325 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  41.77 
 
 
342 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  38.8 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  37.46 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  37.46 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  37.46 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  34.8 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  36.98 
 
 
326 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  36.89 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  37.34 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  38.71 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  37.97 
 
 
336 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  34.52 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  40.26 
 
 
323 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  37.18 
 
 
325 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  35.99 
 
 
320 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  38.83 
 
 
317 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  35.78 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  37.54 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  43.01 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  25.73 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  41.53 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  32.27 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  26.38 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  26.38 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  26.38 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  26.38 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  26.38 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  35.71 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  35.71 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  26.21 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  26.06 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  32.99 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  26.06 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  26.06 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  38.93 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  37.19 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  37.13 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  38.19 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  35.11 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>