114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  100 
 
 		 316 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  79.94 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  78.98 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  62.46 
 
 		 331 aa  288  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  62.46 
 
 		 331 aa  288  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  62.46 
 
 		 331 aa  288  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  79.41 
 
 		 323 aa  259  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  53.99 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  40.13 
 
 		 329 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  54.14 
 
 		 336 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  48.25 
 
 		 330 aa  218  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  52.41 
 
 		 345 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  43.28 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  47.21 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  45.28 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  43.61 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  57.54 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  45.93 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  62.3 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  44.52 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  45.6 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  46.25 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  46.23 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  42.17 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  46.69 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  41.56 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  53.15 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  43.48 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  44.37 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  41.97 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  43.98 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  43.98 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  40.85 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  38.26 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  35.05 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  29.77 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  29.43 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.76 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  28.76 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  28.76 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  29.1 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  29.78 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  28.15 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  30.15 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  29.41 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  35.6 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  28.96 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  43.4 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  32.67 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  39.47 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  52.08 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  26.57 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  26.28 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  28.98 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  27.19 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  26.67 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  26.13 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  25.69 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  25.27 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  30.12 
 
 		 368 aa  52.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  28.96 
 
 		 351 aa  52.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  24.55 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  33.59 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  33.59 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  33.33 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  23.36 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  26.02 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  24.76 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  30.28 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  26.67 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  25.53 
 
 		 355 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  34.83 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  34.83 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  34.83 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  34.83 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  24.48 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  24.44 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  21.43 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  24.44 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  22.73 
 
 		 350 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  27.08 
 
 		 357 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  24.61 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  30.28 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  25.31 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  24.13 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  30 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  26.4 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  30.28 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  26.81 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  21.28 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  23.84 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  28.28 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  22.22 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  25.16 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  32.26 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  24.93 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  28.17 
 
 		 381 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>