53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4131 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 325 aa  600  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  69.35 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  56.15 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  56.51 
 
 		 318 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  55.77 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  54.55 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  59.41 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  54.11 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  53.85 
 
 		 325 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  38.83 
 
 		 329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  44.23 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  42.53 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  44.73 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  43.66 
 
 		 317 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  43.09 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  45.49 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  38.59 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  39.31 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  41.07 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  41.07 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  41.07 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  45.31 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  42.39 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  40.43 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  42.45 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  37.5 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  39.5 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  45.64 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  47.25 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  43.27 
 
 		 247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  43.27 
 
 		 247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  42.04 
 
 		 343 aa  113  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  38.71 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  41.77 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  41.64 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  43.23 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  26.4 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  63.89 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  26.95 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  26.62 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  27.36 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  26.95 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  26.95 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  26.95 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  26.95 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  26.95 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  26.62 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  31.77 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  33.22 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  30.58 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  28.11 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  25.44 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  32.58 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>