98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1965 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 322 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  74.38 
 
 		 322 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  72.7 
 
 		 318 aa  414  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  62.62 
 
 		 326 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  69.88 
 
 		 323 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  60.87 
 
 		 325 aa  315  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  60.76 
 
 		 325 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  46.86 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  55.77 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  54.87 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  48.56 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  48.24 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  45.16 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  49.2 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  48.24 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  43.71 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  45.62 
 
 		 325 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  46.56 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  49.68 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  46.96 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  44.98 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  43.97 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  43.97 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  43.97 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  48.87 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  38.92 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  46.92 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  46.92 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  48.54 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  48.9 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  45.45 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43.61 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  42.12 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  44.13 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43.45 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  36.77 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.74 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  27.37 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  28.24 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  28.35 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  26.67 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.95 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.56 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  27.56 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  27.56 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.56 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  31.78 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  37.17 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  22.6 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  34.25 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  51.72 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  31.64 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  25.32 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  23.19 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  25.29 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  27.34 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  24.1 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  25.26 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  24.48 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  24.48 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  24.26 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  28.18 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  24.68 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  29.11 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  28.18 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  28.18 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  27.16 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  28.18 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  28.18 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  28.18 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  28.18 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  28.18 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  28.18 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  26.43 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  24.49 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  31.58 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  26.37 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  26.58 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  25.31 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  31.76 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  25.82 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  23.08 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  30 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  30 
 
 		 358 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  25.5 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  23.49 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  29.09 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  25.95 
 
 		 381 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  26.55 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  29.09 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  22.15 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  24.84 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  26.55 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  22.12 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  23.42 
 
 		 355 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  23.93 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  27.27 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>