More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0071 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 
329 aa  636    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  70.72 
 
 
327 aa  386  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  48.58 
 
 
321 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  48.26 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  48.26 
 
 
321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  48.9 
 
 
321 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  48.58 
 
 
321 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  48.9 
 
 
321 aa  311  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  48.26 
 
 
321 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  47.95 
 
 
321 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  47.95 
 
 
321 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  47.95 
 
 
321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  45.06 
 
 
323 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  44.19 
 
 
334 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  30.56 
 
 
381 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  30.56 
 
 
381 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  29.97 
 
 
381 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  29.67 
 
 
381 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  29.38 
 
 
351 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  28.78 
 
 
359 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  29.29 
 
 
361 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  27.67 
 
 
362 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  28.78 
 
 
389 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  30.27 
 
 
351 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  30.06 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  30.8 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  28.49 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  29.88 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  28.78 
 
 
362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  28.57 
 
 
384 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  27.73 
 
 
350 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  27.89 
 
 
355 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  27.6 
 
 
354 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  28.78 
 
 
357 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  27.51 
 
 
349 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  29.97 
 
 
348 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  29.39 
 
 
358 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  28.24 
 
 
353 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  28.49 
 
 
358 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  27.89 
 
 
346 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  28.36 
 
 
354 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  27.89 
 
 
346 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  27.89 
 
 
346 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  27.6 
 
 
346 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  27.89 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  27.89 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  27.3 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0666  arsenical-resistance protein  29.18 
 
 
395 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  27.3 
 
 
346 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  28.72 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  31.14 
 
 
352 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  27.6 
 
 
350 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  28.87 
 
 
353 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  27.3 
 
 
346 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  27.73 
 
 
352 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  27.81 
 
 
352 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  27 
 
 
350 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  28.15 
 
 
355 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  27.6 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  24.63 
 
 
350 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  27.81 
 
 
351 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  27.49 
 
 
358 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  27.49 
 
 
361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  31.49 
 
 
357 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  27.19 
 
 
361 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  29.68 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  29.07 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  31.14 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  25.3 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  28.78 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0911  arsenical-resistance protein  29.66 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  0.11905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  25.52 
 
 
350 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  28.53 
 
 
367 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  28.45 
 
 
377 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  25.74 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  30.68 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  25.82 
 
 
354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3445  arsenical-resistance protein  29.15 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  27.14 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  27.46 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  29.55 
 
 
346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  26.71 
 
 
353 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3442  arsenical-resistance protein  28.57 
 
 
395 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  27.89 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  27.3 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  27.4 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  25.52 
 
 
350 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  29.35 
 
 
354 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  25.59 
 
 
343 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3465  arsenical-resistance protein  26.92 
 
 
354 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  26.96 
 
 
372 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  25 
 
 
351 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  30.54 
 
 
367 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  29.97 
 
 
368 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  28.78 
 
 
371 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  28.19 
 
 
356 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  30.06 
 
 
367 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  28.78 
 
 
350 aa  123  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  29.09 
 
 
349 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  30 
 
 
354 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>