78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18500 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  100 
 
 		 325 aa  620  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  68.35 
 
 		 317 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  71.16 
 
 		 320 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  68.35 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  67.72 
 
 		 317 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  66.46 
 
 		 317 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  47.96 
 
 		 329 aa  295  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  69.95 
 
 		 247 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  69.95 
 
 		 247 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  47.19 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  45.62 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  47.47 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  47.38 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  42.59 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  45.98 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  42.27 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  42.27 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  42.27 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  40.5 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  45.13 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  36.62 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  44.37 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  38.02 
 
 		 336 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  45.62 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  42.67 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  43.59 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  41.16 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  42.77 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  36.48 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  41.19 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  39.03 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  44.52 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  41.67 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  42.18 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  38.59 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.94 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  28.36 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  28.21 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  28.57 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  28.57 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  28.57 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.57 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  28.57 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  38.97 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  28.21 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.84 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  29.31 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  35.11 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  33.08 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  30.67 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  40.59 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  24 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  25.18 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  22.47 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  23.62 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  23.24 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  22.33 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  24.68 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  22.14 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  24.43 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  22.29 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  26.12 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  26.71 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  28.71 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  22.14 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  26.26 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  24.48 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  28.7 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  25.34 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  23.68 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  20.97 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  23.62 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  27.81 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  23.97 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  23.33 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  29.55 
 
 		 318 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  24.19 
 
 		 357 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  24.86 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>