80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1550 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 321 aa  608  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  48.9 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  36.25 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  43.71 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  41.21 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  44.76 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  49.2 
 
 		 319 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  39.63 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  40.62 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  40.62 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  40.62 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  48.1 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  40.45 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  44.09 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  40.69 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  37.78 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  39.17 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  42.77 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  36.62 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  36.66 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  38.22 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  40.13 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  38.41 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  42.81 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  38.83 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  39.31 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  35.33 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  41.53 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  38.17 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  41.51 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  44.89 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  35.74 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  35.74 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  27.72 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.72 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.07 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  41.77 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.02 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  27.02 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  27.02 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  27.02 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  27.02 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.02 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.02 
 
 		 321 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  40.07 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  38.28 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  37.01 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  31.47 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  31.34 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  45.83 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  23.03 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  21.84 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  21.55 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  25 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  21.84 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  25.27 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  25.9 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  31.58 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  23.68 
 
 		 355 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  22.58 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  22.26 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  23.03 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  22.9 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  22.26 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  22.26 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  22.26 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  22.46 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  22.09 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  22.66 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  30 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  21.11 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  19.64 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  22.18 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  20.7 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  29.35 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  23.65 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  29.66 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  22.74 
 
 		 389 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  21.25 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  23.46 
 
 		 381 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>