240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2303 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 334 aa  649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  77.85 
 
 		 325 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  60.06 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  54.23 
 
 		 515 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  61.32 
 
 		 324 aa  350  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  57.45 
 
 		 325 aa  345  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  56.88 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  55.69 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  54.85 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  54.1 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  36.45 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  29.9 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  28.28 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  28.95 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  26.3 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  25.71 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  27.48 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  27.69 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  25.71 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  27.87 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  27.57 
 
 		 374 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.31 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.78 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  24.79 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  27.31 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  25.47 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  28.25 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  26.86 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.68 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  24.59 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  26.18 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  27.68 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  26.38 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  27.68 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  26.47 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  25.7 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  25.88 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  27.39 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.68 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  28.83 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  27.21 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  24.18 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  26.14 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  27.31 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  24.18 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  27.31 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  23.86 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  25.99 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  25.88 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  27.01 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  27.3 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  26.14 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  23.86 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  24.18 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  26.33 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  24.8 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  23.84 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  24.26 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  26.52 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  26.77 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  26.58 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  25.07 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  23.36 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  26.2 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  23.64 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  25.33 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  26.74 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  24.28 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  24.02 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  24.02 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  25.63 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  26.77 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  24.61 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  24.75 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  24.68 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  25.08 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  26.38 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  24.92 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  26.05 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  25.08 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  23.15 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  24.41 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  23.96 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  24.76 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  23.58 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  29.46 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  25.67 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  26 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  23.03 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1555  arsenical-resistance protein ACR3  25.75 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.362934  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  25.96 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  24.76 
 
 		 381 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  23.78 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  23.62 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>