273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2954 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  100 
 
 
350 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  91.14 
 
 
350 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  90.86 
 
 
350 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  86.71 
 
 
353 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  86.71 
 
 
352 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  85.71 
 
 
351 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  85.26 
 
 
346 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  76.3 
 
 
350 aa  552  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  77.08 
 
 
389 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  70.11 
 
 
351 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  69.83 
 
 
351 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  71.59 
 
 
362 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  70.43 
 
 
351 aa  498  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  68.62 
 
 
346 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  71.47 
 
 
381 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  66.18 
 
 
348 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  68.33 
 
 
346 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  67.73 
 
 
346 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  70.61 
 
 
381 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  69.05 
 
 
362 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  68.33 
 
 
346 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  68.33 
 
 
346 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  70.47 
 
 
381 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  67.44 
 
 
346 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  67.44 
 
 
346 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  67.44 
 
 
346 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  69.79 
 
 
352 aa  485  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  68.31 
 
 
355 aa  484  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  67.74 
 
 
346 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  69.59 
 
 
381 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  69.19 
 
 
348 aa  480  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  69.5 
 
 
353 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  70.46 
 
 
328 aa  474  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  68.22 
 
 
352 aa  471  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  69.62 
 
 
354 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  67.87 
 
 
351 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  65.4 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  66.76 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  63.98 
 
 
361 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  67.59 
 
 
328 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  65.12 
 
 
350 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  64.27 
 
 
357 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  64.81 
 
 
349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  66.18 
 
 
350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  65.8 
 
 
358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  64.43 
 
 
356 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  66.47 
 
 
359 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  63.4 
 
 
358 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  65.62 
 
 
355 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  66.57 
 
 
362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  65.71 
 
 
356 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  67.16 
 
 
349 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  65.59 
 
 
361 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  63.98 
 
 
357 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  64.71 
 
 
361 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  63.66 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0911  arsenical-resistance protein  63.74 
 
 
366 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  0.11905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  63.48 
 
 
355 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  67.54 
 
 
353 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  63.48 
 
 
352 aa  431  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  67.8 
 
 
360 aa  428  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  63.27 
 
 
354 aa  430  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  59.42 
 
 
351 aa  421  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  61.05 
 
 
358 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  61.52 
 
 
351 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  63.77 
 
 
357 aa  418  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  63.66 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3465  arsenical-resistance protein  59.06 
 
 
354 aa  411  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  59.94 
 
 
358 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  58.67 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  58.82 
 
 
343 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1933  arsenical-resistance protein  56.85 
 
 
348 aa  391  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  57.59 
 
 
354 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  56.65 
 
 
354 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  56.7 
 
 
384 aa  385  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3445  arsenical-resistance protein  56.86 
 
 
386 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  54.62 
 
 
374 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  55.36 
 
 
369 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3442  arsenical-resistance protein  55.14 
 
 
395 aa  374  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0666  arsenical-resistance protein  54.73 
 
 
395 aa  371  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  54.39 
 
 
377 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  55.16 
 
 
356 aa  368  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  53.04 
 
 
368 aa  363  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  52.94 
 
 
350 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  55.13 
 
 
360 aa  362  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  53.69 
 
 
368 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  51.46 
 
 
378 aa  352  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  51.62 
 
 
371 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  53.41 
 
 
348 aa  349  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  51.78 
 
 
367 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  52.19 
 
 
367 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  51.9 
 
 
368 aa  345  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  51.9 
 
 
367 aa  345  5e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  51.59 
 
 
369 aa  345  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  53.06 
 
 
363 aa  344  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  52.2 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  52.68 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0212  arsenical-resistance protein  51.92 
 
 
365 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  51.61 
 
 
363 aa  342  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  54.12 
 
 
363 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>