97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2727 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 342 aa  647    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  57.91 
 
 		 345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  54.78 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  54.78 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  54.78 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  53.05 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  46.56 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  44.69 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  41.01 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  60 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  55.13 
 
 		 326 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  45.28 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  46.62 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  45.4 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  43.81 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  41.01 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  45.69 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  57.19 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  45.62 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  41.85 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  53.99 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  45.9 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  43.81 
 
 		 325 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  46.33 
 
 		 317 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  45.43 
 
 		 320 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  45.05 
 
 		 317 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  52.58 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  52.53 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  42.39 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  38.54 
 
 		 336 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  54.92 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  46.33 
 
 		 317 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  43.12 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  43.27 
 
 		 247 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  43.27 
 
 		 247 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  41.77 
 
 		 319 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  26.13 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  26.13 
 
 		 321 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  26.13 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  25.78 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  25.77 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  25 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  25.44 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  25.87 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  25.96 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  25.96 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  47.92 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  35.54 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  28.11 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  33.88 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  20.85 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3445  arsenical-resistance protein  23.55 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  21.66 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  23.75 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  23.77 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  23.6 
 
 		 368 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  22.19 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  23.44 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  19.3 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  25.74 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  23.99 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  21.97 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  20 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  23.62 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  22.9 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  22.74 
 
 		 351 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  22.55 
 
 		 354 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  23.43 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  24.93 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  22.69 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  25.98 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  22.74 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  29.06 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  22.64 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  24.7 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  22.55 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  28.42 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  22.47 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  22.18 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  27.27 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  23.96 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  21.67 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  22.45 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  22.42 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1933  arsenical-resistance protein  30.47 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  23.33 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  24.29 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3442  arsenical-resistance protein  21.41 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  21.64 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  22.12 
 
 		 346 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  23.66 
 
 		 361 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  22.69 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  23.81 
 
 		 360 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  26.26 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  19.57 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>