153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0421 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 
331 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  82.66 
 
 
326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  78.98 
 
 
316 aa  328  6e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  61.46 
 
 
331 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  61.46 
 
 
331 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  61.46 
 
 
331 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  79.17 
 
 
323 aa  278  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  43.65 
 
 
329 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  56.92 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  55.87 
 
 
345 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  52.08 
 
 
342 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  48.9 
 
 
318 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  44.34 
 
 
322 aa  225  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  48.44 
 
 
330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  45.45 
 
 
322 aa  222  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  45.63 
 
 
317 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  59.81 
 
 
343 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  46.93 
 
 
317 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  43.4 
 
 
325 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  59.3 
 
 
327 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  45.75 
 
 
326 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  48.85 
 
 
323 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  45.63 
 
 
317 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  44.98 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  41.88 
 
 
325 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  42.17 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  42.41 
 
 
321 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  45.74 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  42.72 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  40.06 
 
 
325 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  51.75 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  40.06 
 
 
332 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  39.92 
 
 
247 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  39.92 
 
 
247 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  35.56 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  30.23 
 
 
321 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  29.9 
 
 
321 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  29.57 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  29.84 
 
 
321 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  30.51 
 
 
321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  29.57 
 
 
321 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  30.88 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  30.15 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  28.9 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  28.9 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  37.13 
 
 
319 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  30.43 
 
 
323 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  31.35 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  27.76 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  29.87 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  27.51 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  28.87 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  32.36 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  27.69 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  28.4 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  26.9 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  25.15 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  25.94 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  26.42 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  28 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  26.19 
 
 
352 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 
346 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  25.94 
 
 
346 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  25.71 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  26.88 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  25.94 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  26.86 
 
 
367 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  32.08 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  25.71 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  24.34 
 
 
346 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  21.67 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  26.65 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  28.62 
 
 
368 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  26.74 
 
 
368 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  26.3 
 
 
360 aa  62.8  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  27.38 
 
 
350 aa  62.8  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  29.92 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  25.68 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  26.07 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  23.49 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  24.93 
 
 
381 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  26.86 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  25.61 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  24 
 
 
353 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  25.3 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  28.07 
 
 
363 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  27.27 
 
 
367 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  25.99 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  24.63 
 
 
381 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  28.31 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  25.99 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  23.03 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>