134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4948 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 336 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  57.23 
 
 		 331 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  57.23 
 
 		 331 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  57.23 
 
 		 331 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  60.25 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  45.4 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  51.79 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  52.87 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  54.89 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  62.42 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  43.04 
 
 		 322 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  44.98 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  48.22 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  54.14 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  46.95 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  47.59 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  43 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  47.59 
 
 		 317 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  54.2 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  43.95 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  43.08 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  47.56 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  56.92 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  44.37 
 
 		 320 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  42.14 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  43.59 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  42.45 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  40.84 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  52.25 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  43.09 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  46.3 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  53.97 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  39.32 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  45.19 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  45.19 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  37.97 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  26.67 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  26.67 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  28.4 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  28.4 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  28.4 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  28.4 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  26.32 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.31 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  25.96 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  25.26 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  30.62 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  49.48 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  35.29 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  26.01 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  34.4 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  26.09 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  23.19 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  24.03 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  27.38 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  27.44 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  25.93 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  24.91 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  28.3 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  24.35 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  27.8 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  26.17 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  26.4 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  21.64 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  25.39 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  26.17 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  24.51 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  25.39 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  25.9 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  24.92 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  23.97 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  25.59 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  24.51 
 
 		 351 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  25.93 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  23.23 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  27.04 
 
 		 367 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  23.14 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  23.34 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  24.09 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  23.23 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  29.55 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  26.98 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  22.01 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  26.67 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  28.93 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  22.07 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  24.07 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  22.53 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  21.74 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  30.52 
 
 		 368 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  23.13 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  27.17 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  22.7 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  23.39 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  22.6 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  23.15 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  24.71 
 
 		 355 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  29.03 
 
 		 363 aa  46.2  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  30 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2651  hypothetical protein  58.14 
 
 		 73 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>