269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3134 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  100 
 
 
357 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  96.36 
 
 
358 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  81.72 
 
 
362 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  82.68 
 
 
358 aa  583  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  82.1 
 
 
355 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  78.27 
 
 
359 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  78.06 
 
 
354 aa  554  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  80.23 
 
 
352 aa  549  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  79.72 
 
 
360 aa  537  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  80.59 
 
 
345 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  70.82 
 
 
357 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  74.41 
 
 
353 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  64.27 
 
 
350 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  64.24 
 
 
351 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  64.24 
 
 
351 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  65.54 
 
 
381 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  64.41 
 
 
346 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  63.82 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  64.12 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  64.41 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  64.41 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  63.82 
 
 
346 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  64.69 
 
 
381 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  63.19 
 
 
350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  65.31 
 
 
351 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  65.12 
 
 
350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  64.41 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  65.1 
 
 
350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  64.41 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  65.13 
 
 
352 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  63.34 
 
 
389 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  65.14 
 
 
381 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  64.41 
 
 
346 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  63.51 
 
 
362 aa  448  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  64.57 
 
 
381 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  64.27 
 
 
355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3465  arsenical-resistance protein  65.13 
 
 
354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  66.67 
 
 
352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  63.19 
 
 
351 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  61.65 
 
 
362 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  62.5 
 
 
346 aa  434  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  62.79 
 
 
353 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  63.64 
 
 
352 aa  435  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  62.79 
 
 
348 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  62.46 
 
 
353 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  60.35 
 
 
350 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  59.48 
 
 
354 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  63.78 
 
 
328 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  58.77 
 
 
349 aa  422  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  59.31 
 
 
356 aa  418  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  59.88 
 
 
351 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  62.54 
 
 
328 aa  418  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  59.6 
 
 
350 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  59.59 
 
 
343 aa  418  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  58.55 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  61.45 
 
 
351 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  57.51 
 
 
348 aa  411  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  60.58 
 
 
354 aa  414  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  59.08 
 
 
361 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  59.71 
 
 
352 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  61.45 
 
 
358 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  59.32 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  60.23 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  59.77 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  57.39 
 
 
361 aa  401  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  56.53 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0911  arsenical-resistance protein  59.94 
 
 
366 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  0.11905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  58.96 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  59.35 
 
 
349 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  57.18 
 
 
358 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  56.41 
 
 
377 aa  381  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  53.14 
 
 
372 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1933  arsenical-resistance protein  54.2 
 
 
348 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  55.59 
 
 
356 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  54.7 
 
 
354 aa  368  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  54.73 
 
 
350 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  53.57 
 
 
384 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  54.7 
 
 
354 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  55.75 
 
 
369 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  55.17 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  53.95 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  53.37 
 
 
369 aa  355  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  52.55 
 
 
347 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3445  arsenical-resistance protein  53.14 
 
 
386 aa  354  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  54.97 
 
 
374 aa  352  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0666  arsenical-resistance protein  53.61 
 
 
395 aa  350  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  53.28 
 
 
378 aa  350  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0212  arsenical-resistance protein  52.21 
 
 
365 aa  348  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  53.45 
 
 
367 aa  348  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  55.11 
 
 
363 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  54.71 
 
 
360 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  52.71 
 
 
367 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  52.87 
 
 
365 aa  345  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  52.87 
 
 
368 aa  345  8e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  53.85 
 
 
363 aa  344  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3442  arsenical-resistance protein  52.78 
 
 
395 aa  344  1e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  53.62 
 
 
348 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  52.59 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  51.72 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  52.17 
 
 
371 aa  342  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>