103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1488 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  100 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  85.92 
 
 		 320 aa  328  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  72.3 
 
 		 317 aa  294  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  73.24 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  72.17 
 
 		 317 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  69.95 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  74.88 
 
 		 317 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  45.54 
 
 		 329 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  46.92 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  44.55 
 
 		 322 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  48.82 
 
 		 318 aa  154  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  44.25 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  48.58 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  42 
 
 		 326 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  43.35 
 
 		 325 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  44.39 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  43.27 
 
 		 342 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  39.84 
 
 		 331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  39.84 
 
 		 331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  39.84 
 
 		 331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  41.71 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  45.19 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  37.5 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  35.74 
 
 		 321 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  37.5 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  36.88 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  36.88 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  36.88 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  36.25 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  36.25 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  38.25 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  36.25 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  36.25 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  36.25 
 
 		 321 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  42.44 
 
 		 323 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43.93 
 
 		 316 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  40 
 
 		 345 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  46.85 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  43.29 
 
 		 325 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  42.4 
 
 		 331 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  44.83 
 
 		 323 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  35.78 
 
 		 332 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  44.07 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  38.13 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  31.54 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  33.87 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  35.71 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  34.45 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  44.02 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  26.24 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  26.76 
 
 		 372 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  25.41 
 
 		 354 aa  52.4  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  23.38 
 
 		 362 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  23.73 
 
 		 362 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  22.35 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  24.39 
 
 		 350 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 		 353 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  23.7 
 
 		 381 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  25.93 
 
 		 356 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  25.42 
 
 		 354 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  25.52 
 
 		 350 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 381 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 381 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  23.6 
 
 		 345 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  23.46 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  21.61 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  26.8 
 
 		 321 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  21.78 
 
 		 354 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  22.73 
 
 		 389 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  22.11 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  57.89 
 
 		 127 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  22.83 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  24 
 
 		 350 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  23.45 
 
 		 348 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  22.84 
 
 		 362 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  22.86 
 
 		 381 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  24.84 
 
 		 325 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  22.28 
 
 		 351 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  23.83 
 
 		 358 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  22.08 
 
 		 350 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 351 aa  45.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  26.95 
 
 		 346 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  24.4 
 
 		 329 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  23.46 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  25.2 
 
 		 358 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  22.16 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  23.35 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  25.86 
 
 		 357 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  25.2 
 
 		 360 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  21.26 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  23 
 
 		 354 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  24.44 
 
 		 357 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0356  arsenical-resistance protein  23.74 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  23.64 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  26.4 
 
 		 353 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  23.83 
 
 		 377 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  24.29 
 
 		 353 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  25.78 
 
 		 357 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>