42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06410 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  38.03 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  54.41 
 
 		 331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  54.41 
 
 		 331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  54.41 
 
 		 331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  50.95 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  46.15 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  51.72 
 
 		 326 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  47.8 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  51.23 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  48.78 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  44.07 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  42.13 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  45.15 
 
 		 326 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  47.34 
 
 		 330 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  51.67 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  47.8 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  47.77 
 
 		 323 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  57.14 
 
 		 343 aa  96.3  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  43.4 
 
 		 325 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  44.23 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  43.66 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  49.68 
 
 		 325 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  47.8 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  49.75 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  40.86 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  52.94 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  46.86 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  52.89 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  37.56 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  50 
 
 		 323 aa  78.6  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  48.33 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  32.17 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  31.95 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  37.81 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  28.12 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  28.12 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.6 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  27.6 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.12 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  27.6 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.12 
 
 		 321 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>