94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4674 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 311 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  62.94 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  42.81 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  54.8 
 
 		 336 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  57.39 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  65.81 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  48.9 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  55.21 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  55.21 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  55.21 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  50.72 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  44.68 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  52.77 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  49.47 
 
 		 330 aa  201  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  45.76 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  49.31 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  51.93 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  45.09 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  45.02 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  47.8 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  45.64 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  41.48 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  42.18 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  41.54 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  53.33 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  41.61 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  43.38 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  41.22 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  52.31 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  53.46 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  43.01 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  54.2 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  37.87 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  48.05 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  48.05 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  42.91 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.46 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  28.9 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.69 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  28.08 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.69 
 
 		 321 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.69 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.08 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.69 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  27.31 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  27.31 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  48.19 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  20.86 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  21.4 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  28.33 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  27.03 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  22.4 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  24.68 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  24.27 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  25.56 
 
 		 367 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  22.53 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  25.08 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  25.93 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  23.36 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  23.4 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  23.46 
 
 		 356 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  34.52 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  23.36 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  22.86 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  36.9 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  24.66 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  25.26 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  25.17 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  24.81 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  24.81 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  22.86 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  22.4 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  24.12 
 
 		 381 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  23.15 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  27.74 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  23.4 
 
 		 381 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  25.1 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  23.74 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  22.02 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  21.03 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  23.62 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  22.67 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  20.83 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  23.4 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1555  arsenical-resistance protein ACR3  24.33 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.362934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  21.8 
 
 		 358 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  23.2 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  20.58 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3445  arsenical-resistance protein  23.12 
 
 		 386 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  17.73 
 
 		 347 aa  42.7  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  21.3 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  20.87 
 
 		 361 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 384 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>