265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1478 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  100 
 
 		 358 aa  708    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  80.29 
 
 		 351 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  78.95 
 
 		 351 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  63.82 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  66.76 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  65.09 
 
 		 343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  64.41 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  63.64 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  64.96 
 
 		 355 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  61.52 
 
 		 351 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  61.06 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  60.47 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  60.17 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  61.06 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  60.47 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  60.81 
 
 		 351 aa  435  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  63.93 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  60.93 
 
 		 351 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  61.11 
 
 		 351 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  59.59 
 
 		 346 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  57.88 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  63.07 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  60.77 
 
 		 346 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  60.18 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  61.84 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  62.06 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  61.88 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  63.05 
 
 		 354 aa  432  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  61.56 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  62.61 
 
 		 353 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  60.77 
 
 		 346 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  63.34 
 
 		 351 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  63.53 
 
 		 352 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  59.37 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  62.17 
 
 		 381 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  61.88 
 
 		 362 aa  428  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  59.41 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  62.46 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  60.82 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  59.71 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  61.05 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  63.28 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  61.58 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  62.35 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  61.58 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  63.31 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  61.29 
 
 		 381 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  59.24 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  61 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  60.23 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  61.29 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  58.62 
 
 		 355 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  61.65 
 
 		 358 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  59.59 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  58.67 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  60.7 
 
 		 381 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  61 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  61.47 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  61.23 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0911  arsenical-resistance protein  58.97 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  0.11905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  58.77 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  61.45 
 
 		 357 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1933  arsenical-resistance protein  57.06 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  59.94 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  64.2 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3465  arsenical-resistance protein  59.82 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  55.62 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  58.93 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  55.75 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  61.61 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  60.17 
 
 		 357 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  60.38 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  55.26 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  55.26 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  53.75 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  50.96 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  53.45 
 
 		 350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  51.61 
 
 		 368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  50.15 
 
 		 377 aa  353  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  51.33 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  48.18 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  51.32 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  49.86 
 
 		 367 aa  349  4e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  49 
 
 		 367 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  52.51 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  53.04 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  52.11 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  50.87 
 
 		 367 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  49.7 
 
 		 348 aa  346  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3445  arsenical-resistance protein  49.72 
 
 		 386 aa  345  8.999999999999999e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  50.7 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  48.6 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  50.14 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4905  arsenical-resistance protein  50.73 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4522  arsenical-resistance protein  50.73 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4609  arsenical-resistance protein  50.73 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  49.42 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3442  arsenical-resistance protein  51.97 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  51.2 
 
 		 371 aa  336  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  48.85 
 
 		 363 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>