112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1983 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 322 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  74.38 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  68.99 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  59.81 
 
 		 326 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  65.83 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  62.5 
 
 		 325 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  61.92 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  55.45 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  56.15 
 
 		 325 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  44.05 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  45.65 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  44.59 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  47.19 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  45.65 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  47.92 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  47.2 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  41.21 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  44.69 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  48.22 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  44.73 
 
 		 317 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  43.18 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  46.77 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  40.72 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  40.72 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  40.72 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  39.23 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  48.7 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  44.55 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  44.55 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  44.57 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  44.34 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43.28 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  39.81 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  43.18 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  41.21 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  27.53 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  33.65 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  27.56 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.06 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  27.17 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  27.17 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.17 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  27.17 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  27.17 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  26.77 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  26.38 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  35.59 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  27.33 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  27.41 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  24.75 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  31.45 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  29.93 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  25.82 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  25.82 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  27.51 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  23.76 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  24.01 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  25.93 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  26.74 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  25.58 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  25.1 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  25.1 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  25.1 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  30.54 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  23.26 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  27.41 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  24.52 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  28.04 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  27.64 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  23.84 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  27.04 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  24.73 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  23.21 
 
 		 346 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  25.57 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  53.33 
 
 		 255 aa  49.7  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  29.1 
 
 		 354 aa  49.3  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  24.81 
 
 		 381 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  26.34 
 
 		 381 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  19.9 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3445  arsenical-resistance protein  25.46 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  22.52 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  24.76 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  25.19 
 
 		 381 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  24.05 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  25.79 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0666  arsenical-resistance protein  26.2 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3442  arsenical-resistance protein  25.37 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  25.16 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  24.62 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  20.52 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  25.77 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  21.85 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  22.01 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>