More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0554 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 350 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  31.63 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  33.86 
 
 		 515 aa  149  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  30.46 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  36.63 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  35.03 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  34.71 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  33.45 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  33.44 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  33.76 
 
 		 331 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  33.21 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  27.22 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  27.65 
 
 		 356 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  28.31 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  24.34 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  32.08 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  31.1 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  26.44 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  25 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  25.96 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  26.46 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.86 
 
 		 321 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  28.43 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1555  arsenical-resistance protein ACR3  27.38 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.362934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  28.62 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  27.92 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  25.99 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.45 
 
 		 321 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  28.43 
 
 		 321 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  28.43 
 
 		 321 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  23.77 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  27.92 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  26.09 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  23.39 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  24.78 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  24.29 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  24.24 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  27.84 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  26.52 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  25.66 
 
 		 350 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.12 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  23.44 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  24.69 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  27.15 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  25.6 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  26.23 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  24.83 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  26.09 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  22.85 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  21.66 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  25.6 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  26.42 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  26.09 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  25.75 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  26.09 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  25.07 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  26.09 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  24.64 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  26.09 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  24.64 
 
 		 351 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  24.18 
 
 		 352 aa  92.8  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  22.85 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  23.37 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  25.62 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  24.06 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  23.08 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  21.66 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3333  arsenical-resistance protein  26.88 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  24.49 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  24.93 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0212  arsenical-resistance protein  23.31 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  28.33 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  24.08 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  25.42 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  23.51 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  25.75 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  23.03 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  24.23 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  24.07 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  24.07 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  23.14 
 
 		 361 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  22.77 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  22.81 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  24.25 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  27.24 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  22.25 
 
 		 365 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  23.46 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  25.25 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  26.25 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  25.58 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  27.56 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  25.08 
 
 		 328 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  22.85 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  24.08 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  23.19 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  24.77 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  29.97 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  22.71 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>