288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1578 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  100 
 
 		 323 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  76.1 
 
 		 324 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  58.31 
 
 		 515 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  60.56 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  59.19 
 
 		 331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  58.15 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  57.5 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  60.06 
 
 		 334 aa  334  9e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  58.88 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  56.92 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  38.91 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  32.11 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  32.19 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  31.69 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  26.33 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  25.88 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  26.33 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  25.83 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  25.38 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  26.09 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  26.12 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  29.24 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  26.17 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  25.87 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  25.23 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  25.56 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  25.24 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  26.54 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  25.75 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  25.75 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  27.05 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  26.43 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  26.12 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  25.68 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  25.24 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  25.75 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  25.75 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  25.37 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  25.75 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  23.97 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  23.58 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  25.37 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  25.37 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  25.08 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  24.92 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  24.34 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  23.86 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  23.99 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  24.92 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  25.65 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  23.01 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1555  arsenical-resistance protein ACR3  25.83 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.362934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  27.01 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  26.69 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  24.38 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  23.3 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  22.68 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  23.3 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  26.04 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  24.51 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  24.15 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  22.95 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  22.95 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0334  arsenical-resistance protein  27.14 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  23.13 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  23.3 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  25.65 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  24.36 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  24.04 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  23.58 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1933  arsenical-resistance protein  24.28 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  26.1 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  24.45 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  24.53 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  25.31 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  25.65 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  22.87 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  24.53 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  24.37 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  22.36 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  24.15 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  24.21 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  25.39 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  24.16 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  26.77 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  24.43 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  24.72 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  23.45 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  23.68 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0652  bile acid:sodium symporter  26.06 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.927211  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  24.85 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1303  arsenical-resistance protein  24.68 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  25.24 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  23.95 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  22.29 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  25.23 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  25.82 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3640  arsenical-resistance protein  27.13 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  24.05 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>