192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0172 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 
328 aa  636    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  31.63 
 
 
350 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  30.8 
 
 
323 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  24.75 
 
 
338 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  26.71 
 
 
515 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  28.72 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  29.51 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  28.28 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0756  arsenical-resistance protein  23.15 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.442454  hitchhiker  0.00390365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  25 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1095  arsenite efflux pump  26.13 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000341702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  23.82 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  23.88 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  28.81 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  26.14 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  23.24 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  26.04 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  24.84 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1933  arsenical-resistance protein  22.52 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1111  bile acid:sodium symporter  28.88 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  21.78 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  24 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  24.75 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0356  arsenical-resistance protein  27.71 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  23.74 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  24.91 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  24.43 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  23.43 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  24.61 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3275  arsenical-resistance protein  25 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0818  hypothetical protein  26.34 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1910  arsenical-resistance protein  27.01 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000179597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  23.08 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  23.98 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  23.53 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  22.74 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  24.31 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  23.02 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1303  arsenical-resistance protein  27.4 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  23.05 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0416  arsenical-resistance protein  24.65 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  23.15 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  24.91 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  24.91 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  23.43 
 
 
349 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  23.49 
 
 
371 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0334  arsenical-resistance protein  26.21 
 
 
385 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  22.77 
 
 
389 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  21.45 
 
 
346 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  20.85 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  22.31 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0959  arsenical-resistance protein  25 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  24.22 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  20.96 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  22.15 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  20.87 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  21.7 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  23.48 
 
 
348 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  21.81 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  21.48 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4003  bile acid:sodium symporter  22.19 
 
 
339 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  21.68 
 
 
351 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  21.88 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  24.8 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  21.88 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  22.27 
 
 
346 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3333  arsenical-resistance protein  25.61 
 
 
384 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  23.17 
 
 
354 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4386  arsenical-resistance protein  22.63 
 
 
354 aa  59.3  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  24.42 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  22.52 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  20.92 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2589  arsenical-resistance protein  23.11 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.441195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  21.64 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  24.08 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1822  putative arsenic resistance protein  22.15 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932603  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3442  putative arsenical-resistance protein  24.31 
 
 
366 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  22.01 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  22.66 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  24.84 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1683  arsenical-resistance protein  24.78 
 
 
350 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.896768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1853  arsenical-resistance protein  24.7 
 
 
354 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00716983  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  21.13 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  23.6 
 
 
374 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1843  arsenical-resistance protein  25.72 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  25.95 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  24.03 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  22.92 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  22.66 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2834  arsenical-resistance protein  25 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  23.13 
 
 
351 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  20.78 
 
 
368 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  21.92 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  23.51 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  23.39 
 
 
359 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  20.54 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  22.66 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  21.75 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  23.1 
 
 
351 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  23.45 
 
 
351 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>