270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_4003 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_4003  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 339 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3442  putative arsenical-resistance protein  78.18 
 
 		 366 aa  541  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2589  arsenical-resistance protein  76.26 
 
 		 350 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.441195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3737  arsenical-resistance protein  77.58 
 
 		 345 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1853  arsenical-resistance protein  75.37 
 
 		 354 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00716983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3779  arsenical pump membrane protein, putative  77.81 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.567439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  72.99 
 
 		 351 aa  478  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3833  arsenical-resistance protein  76.56 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3395  bile acid:sodium symporter  74.86 
 
 		 351 aa  474  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0575  arsenical-resistance protein  74.93 
 
 		 349 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1843  arsenical-resistance protein  76.63 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.172285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4386  arsenical-resistance protein  74.04 
 
 		 354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3959  arsenical-resistance protein  76.85 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0534  arsenical pump membrane protein, putative  76.92 
 
 		 339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0418  arsenical-resistance protein  74.25 
 
 		 344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0533  bile acid:sodium symporter  76.26 
 
 		 339 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2834  arsenical-resistance protein  68.84 
 
 		 345 aa  434  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0533  bile acid:sodium symporter  76.7 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3498  bile acid:sodium symporter  76.99 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6303  arsenical-resistance protein  67.66 
 
 		 344 aa  435  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0523  bile acid:sodium symporter  65.28 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27289  normal  0.171222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1822  putative arsenic resistance protein  65.19 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0652  bile acid:sodium symporter  64.22 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.927211  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3126  ACR3 family arsenite efflux pump  62.94 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3856  arsenical-resistance protein  62.35 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  55.75 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3640  arsenical-resistance protein  58.28 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2709  bile acid:sodium symporter  60.59 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0416  arsenical-resistance protein  58.75 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1095  arsenite efflux pump  55.95 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000341702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11311  arsenite efflux pump ACR3  60.29 
 
 		 336 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0544357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1449  bile acid:sodium symporter  57.23 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.939169  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0818  hypothetical protein  53.82 
 
 		 352 aa  358  7e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0616  bile acid:sodium symporter  55.16 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0303  arsenite/antimonite exporter, ArsB like  55.16 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00764186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1938  multidrug-efflux transporter  58.75 
 
 		 353 aa  355  8.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3126  arsenite efflux pump ACR3  53.69 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3117  arsenical-resistance protein  54.28 
 
 		 350 aa  352  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1963  arsenical-resistance protein  54.41 
 
 		 362 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3663  bile acid:sodium symporter  56.18 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1910  arsenical-resistance protein  57.31 
 
 		 351 aa  348  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000179597  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7179  arsenical-resistance protein  53.25 
 
 		 361 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1100  ACR3 family arsenite transporter  59.94 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1518  arsenical-resistance protein  53.1 
 
 		 357 aa  345  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.894233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4175  arsenical-resistance protein  53.1 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0219012  normal  0.638432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1049  arsenical-resistance protein  53.39 
 
 		 355 aa  342  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6065  arsenical pump membrane protein  55.16 
 
 		 364 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2186  arsenical-resistance protein  56.05 
 
 		 349 aa  341  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368686  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3959  arsenical-resistance protein  54.14 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2316  arsenical-resistance protein  53.1 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.460752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3866  arsenical-resistance protein  52.8 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5378  arsenical-resistance protein  52.51 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0958  arsenical resistance protein, putative  54.76 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0330  bile acid:sodium symporter  54.57 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4052  arsenical-resistance protein  53.39 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0700  bile acid:sodium symporter  53.1 
 
 		 355 aa  338  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6328  arsenical-resistance protein  54.46 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.128519  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5599  bile acid:sodium symporter  54.46 
 
 		 368 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19467  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0557  putative arsenical resistance protein  54.17 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0323  bile acid:sodium symporter  53.39 
 
 		 354 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6563  putative arsenate-sodium symporter  54.76 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0649  arsenical-resistance protein  52.8 
 
 		 348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.045154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1526  bile acid:sodium symporter  53.98 
 
 		 354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268235  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3938  arsenical-resistance protein  54.3 
 
 		 356 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3825  arsenical-resistance protein  54.3 
 
 		 356 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.941857  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6163  arsenical-resistance protein  54.46 
 
 		 357 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.425011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2344  ACR3 permease  52.35 
 
 		 363 aa  335  9e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5709  arsenical-resistance protein  54.33 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0208  arsenical-resistance protein  53.69 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.768524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0520  arsenical-resistance protein  52.8 
 
 		 351 aa  331  9e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4214  arsenical-resistance protein  54.03 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5672  arsenical-resistance protein  53.57 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0334  arsenical-resistance protein  50.89 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3118  arsenical-resistance protein  52.37 
 
 		 342 aa  328  6e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30680  arsenical-resistance protein  51.78 
 
 		 357 aa  328  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0877  arsenical-resistance protein  54.57 
 
 		 351 aa  328  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4071  arsenical-resistance protein  52.37 
 
 		 350 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1582  ACR3 permease  52.51 
 
 		 357 aa  328  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1972  bile acid:sodium symporter  53.25 
 
 		 350 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2538  bile acid:sodium symporter  56.05 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.344052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0490  arsenical-resistance protein  52.21 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3670  arsenical-resistance protein  52.02 
 
 		 360 aa  325  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  0.2686 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1282  arsenical-resistance protein  51.18 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1152  arsenical-resistance protein  55.07 
 
 		 349 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1111  bile acid:sodium symporter  56.93 
 
 		 345 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0457  sodium bile acid symporter family protein  54.46 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0579522  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1883  putative arsenical resistance protein  54.46 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1786  arsenical-resistance protein  52.51 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1943  arsenical-resistance protein  54.46 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926392  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0914  putative arsenical resistance protein  54.46 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2038  arsenical-resistance protein  54.46 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1343  arsenical-resistance protein  52.51 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.198617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2517  arsenical-resistance protein  52.51 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4964  bile acid:sodium symporter  54.76 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252603  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3196  arsenical-resistance protein  54.76 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1683  arsenical-resistance protein  53.62 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.896768  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1303  arsenical-resistance protein  53.24 
 
 		 353 aa  319  5e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3333  arsenical-resistance protein  50.43 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1346  sodium/bile acid symporter family protein  50.74 
 
 		 361 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.17677  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0356  arsenical-resistance protein  50.15 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>