255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0323 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0323  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
354 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0616  bile acid:sodium symporter  88.66 
 
 
354 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3126  arsenite efflux pump ACR3  85.19 
 
 
351 aa  592  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1972  bile acid:sodium symporter  85.76 
 
 
350 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4071  arsenical-resistance protein  85.96 
 
 
350 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4052  arsenical-resistance protein  85.55 
 
 
355 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.815051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3417  bile acid:sodium symporter  89.12 
 
 
347 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3866  arsenical-resistance protein  85.13 
 
 
358 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4175  arsenical-resistance protein  84.84 
 
 
358 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0219012  normal  0.638432 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6065  arsenical pump membrane protein  84.66 
 
 
364 aa  547  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1049  arsenical-resistance protein  84.66 
 
 
355 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3959  arsenical-resistance protein  81.3 
 
 
353 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0520  arsenical-resistance protein  82.23 
 
 
351 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0877  arsenical-resistance protein  81.66 
 
 
351 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1786  arsenical-resistance protein  79.06 
 
 
357 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1449  bile acid:sodium symporter  78.82 
 
 
358 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.939169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2316  arsenical-resistance protein  77.62 
 
 
358 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.460752  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0103  arsenical-resistance protein  79.2 
 
 
350 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1282  arsenical-resistance protein  75.58 
 
 
358 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0490  arsenical-resistance protein  76.92 
 
 
361 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0649  arsenical-resistance protein  75.59 
 
 
348 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.045154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2344  ACR3 permease  75 
 
 
363 aa  491  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1426  ACR3 family arsenite transporter  75.22 
 
 
366 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.653925  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0303  arsenite/antimonite exporter, ArsB like  73.43 
 
 
361 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00764186  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1346  sodium/bile acid symporter family protein  70.36 
 
 
361 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.17677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1963  arsenical-resistance protein  74.49 
 
 
362 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3118  arsenical-resistance protein  75.22 
 
 
342 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30680  arsenical-resistance protein  73.96 
 
 
357 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3117  arsenical-resistance protein  71.76 
 
 
350 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2186  arsenical-resistance protein  74.71 
 
 
349 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368686  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0330  bile acid:sodium symporter  74.7 
 
 
354 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5378  arsenical-resistance protein  72.84 
 
 
361 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1526  bile acid:sodium symporter  74.4 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7179  arsenical-resistance protein  72.57 
 
 
361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1582  ACR3 permease  74.27 
 
 
357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1343  arsenical-resistance protein  73.08 
 
 
360 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.198617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3663  bile acid:sodium symporter  74.04 
 
 
355 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2517  arsenical-resistance protein  72.78 
 
 
360 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0208  arsenical-resistance protein  72.7 
 
 
353 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.768524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0700  bile acid:sodium symporter  72.19 
 
 
355 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6163  arsenical-resistance protein  74.03 
 
 
357 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2538  bile acid:sodium symporter  76.19 
 
 
363 aa  461  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.344052  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5599  bile acid:sodium symporter  75.52 
 
 
368 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19467  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6328  arsenical-resistance protein  75.22 
 
 
356 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.128519  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4214  arsenical-resistance protein  75.52 
 
 
365 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438657  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5709  arsenical-resistance protein  74.33 
 
 
357 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5672  arsenical-resistance protein  73.73 
 
 
378 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3938  arsenical-resistance protein  73.89 
 
 
356 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0557  putative arsenical resistance protein  73.59 
 
 
356 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171816  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3825  arsenical-resistance protein  73.89 
 
 
356 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.941857  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6563  putative arsenate-sodium symporter  73.73 
 
 
357 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0958  arsenical resistance protein, putative  72.06 
 
 
356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3196  arsenical-resistance protein  73.59 
 
 
375 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2038  arsenical-resistance protein  73.89 
 
 
356 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5576  putative arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  75.51 
 
 
342 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.918672  normal  0.0850565 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0457  sodium bile acid symporter family protein  73.89 
 
 
356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0579522  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4964  bile acid:sodium symporter  73.59 
 
 
356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1883  putative arsenical resistance protein  73.89 
 
 
356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0914  putative arsenical resistance protein  73.89 
 
 
356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1943  arsenical-resistance protein  73.89 
 
 
356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1518  arsenical-resistance protein  64.79 
 
 
357 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.894233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1822  putative arsenic resistance protein  58.24 
 
 
341 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932603  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3640  arsenical-resistance protein  55.82 
 
 
356 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  52.57 
 
 
351 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2834  arsenical-resistance protein  54.07 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1938  multidrug-efflux transporter  56.89 
 
 
353 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2589  arsenical-resistance protein  54.57 
 
 
350 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.441195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1853  arsenical-resistance protein  54.11 
 
 
354 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00716983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3670  arsenical-resistance protein  55.46 
 
 
360 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  0.2686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4003  bile acid:sodium symporter  53.39 
 
 
339 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0652  bile acid:sodium symporter  54.73 
 
 
357 aa  332  5e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.927211  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3779  arsenical pump membrane protein, putative  53.85 
 
 
338 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.567439  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0523  bile acid:sodium symporter  55.79 
 
 
344 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27289  normal  0.171222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3442  putative arsenical-resistance protein  49.72 
 
 
366 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6303  arsenical-resistance protein  52.46 
 
 
344 aa  329  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0575  arsenical-resistance protein  55.29 
 
 
349 aa  329  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3833  arsenical-resistance protein  54.6 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  47.04 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2709  bile acid:sodium symporter  53.54 
 
 
371 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4386  arsenical-resistance protein  53.64 
 
 
354 aa  322  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3737  arsenical-resistance protein  54.49 
 
 
345 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3395  bile acid:sodium symporter  51.14 
 
 
351 aa  317  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3126  ACR3 family arsenite efflux pump  53.1 
 
 
350 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0534  arsenical pump membrane protein, putative  54.28 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3856  arsenical-resistance protein  54.01 
 
 
350 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0959  arsenical-resistance protein  51.94 
 
 
344 aa  309  4e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3959  arsenical-resistance protein  54.3 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1843  arsenical-resistance protein  51.47 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1100  ACR3 family arsenite transporter  51.8 
 
 
336 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0533  bile acid:sodium symporter  53.98 
 
 
339 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11311  arsenite efflux pump ACR3  51.8 
 
 
336 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0544357 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1152  arsenical-resistance protein  51.61 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0818  hypothetical protein  45.88 
 
 
352 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0533  bile acid:sodium symporter  55.33 
 
 
339 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0418  arsenical-resistance protein  54.07 
 
 
344 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1683  arsenical-resistance protein  51.34 
 
 
350 aa  298  7e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.896768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1910  arsenical-resistance protein  48.53 
 
 
351 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000179597  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1095  arsenite efflux pump  46.13 
 
 
347 aa  297  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000341702  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0416  arsenical-resistance protein  46.9 
 
 
349 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3498  bile acid:sodium symporter  54.73 
 
 
339 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>