288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0818 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0818  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  689    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  75.86 
 
 
349 aa  535  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1095  arsenite efflux pump  71.97 
 
 
347 aa  498  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000341702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1910  arsenical-resistance protein  75.57 
 
 
351 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000179597  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0416  arsenical-resistance protein  74.86 
 
 
349 aa  481  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0334  arsenical-resistance protein  66.38 
 
 
385 aa  449  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0356  arsenical-resistance protein  61.74 
 
 
346 aa  425  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3640  arsenical-resistance protein  61.74 
 
 
356 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1111  bile acid:sodium symporter  70.26 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1303  arsenical-resistance protein  66.29 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2709  bile acid:sodium symporter  62.36 
 
 
371 aa  398  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1152  arsenical-resistance protein  61.27 
 
 
349 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1683  arsenical-resistance protein  59.26 
 
 
350 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.896768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0959  arsenical-resistance protein  61 
 
 
344 aa  378  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3670  arsenical-resistance protein  54.15 
 
 
360 aa  351  8.999999999999999e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  0.2686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  54.15 
 
 
351 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2834  arsenical-resistance protein  55.16 
 
 
345 aa  343  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0523  bile acid:sodium symporter  52.66 
 
 
344 aa  338  8e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27289  normal  0.171222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4003  bile acid:sodium symporter  53.82 
 
 
339 aa  338  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0652  bile acid:sodium symporter  53.54 
 
 
357 aa  335  9e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.927211  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3737  arsenical-resistance protein  53.67 
 
 
345 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6303  arsenical-resistance protein  52.21 
 
 
344 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1822  putative arsenic resistance protein  52.49 
 
 
341 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932603  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3856  arsenical-resistance protein  52.06 
 
 
350 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3126  ACR3 family arsenite efflux pump  52.06 
 
 
350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3779  arsenical pump membrane protein, putative  55.03 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.567439  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1843  arsenical-resistance protein  55.59 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3442  putative arsenical-resistance protein  50.83 
 
 
366 aa  327  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1853  arsenical-resistance protein  51.76 
 
 
354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00716983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0575  arsenical-resistance protein  53.8 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4386  arsenical-resistance protein  54.71 
 
 
354 aa  325  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3333  arsenical-resistance protein  48.16 
 
 
384 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2589  arsenical-resistance protein  51.32 
 
 
350 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.441195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3395  bile acid:sodium symporter  51.43 
 
 
351 aa  322  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3117  arsenical-resistance protein  47.09 
 
 
350 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2372  arsenical-resistance protein  46.74 
 
 
384 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000347723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2321  arsenical-resistance protein  46.74 
 
 
384 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11311  arsenite efflux pump ACR3  52.35 
 
 
336 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0544357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0303  arsenite/antimonite exporter, ArsB like  46.72 
 
 
361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00764186  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3833  arsenical-resistance protein  52.66 
 
 
337 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0418  arsenical-resistance protein  53.55 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3275  arsenical-resistance protein  44.86 
 
 
383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3663  bile acid:sodium symporter  48.42 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2316  arsenical-resistance protein  46.35 
 
 
358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.460752  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1518  arsenical-resistance protein  47.54 
 
 
357 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.894233 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1938  multidrug-efflux transporter  47.85 
 
 
353 aa  301  8.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3713  arsenical-resistance protein ACR3  46.65 
 
 
376 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547945  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5672  arsenical-resistance protein  48.81 
 
 
378 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3126  arsenite efflux pump ACR3  45.29 
 
 
351 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0872  bile acid:sodium symporter  43.3 
 
 
400 aa  300  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.973623  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0667  arsenical-resistance protein  46.29 
 
 
385 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0649  arsenical-resistance protein  45.27 
 
 
348 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.045154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3959  arsenical-resistance protein  47.63 
 
 
353 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1282  arsenical-resistance protein  44.94 
 
 
358 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0700  bile acid:sodium symporter  46.57 
 
 
355 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0520  arsenical-resistance protein  46.76 
 
 
351 aa  295  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5378  arsenical-resistance protein  46.29 
 
 
361 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2882  arsenical-resistance protein  44.33 
 
 
396 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1100  ACR3 family arsenite transporter  51.03 
 
 
336 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5709  arsenical-resistance protein  47.93 
 
 
357 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1343  arsenical-resistance protein  46.69 
 
 
360 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.198617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0490  arsenical-resistance protein  46.24 
 
 
361 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6328  arsenical-resistance protein  47.62 
 
 
356 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.128519  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5599  bile acid:sodium symporter  47.62 
 
 
368 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19467  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2517  arsenical-resistance protein  46.69 
 
 
360 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30680  arsenical-resistance protein  45.35 
 
 
357 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1582  ACR3 permease  46.15 
 
 
357 aa  292  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6563  putative arsenate-sodium symporter  46.75 
 
 
357 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0616  bile acid:sodium symporter  44.15 
 
 
354 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4214  arsenical-resistance protein  46.63 
 
 
365 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3825  arsenical-resistance protein  46.88 
 
 
356 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.941857  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0330  bile acid:sodium symporter  45.24 
 
 
354 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3938  arsenical-resistance protein  46.88 
 
 
356 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6163  arsenical-resistance protein  46.75 
 
 
357 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1049  arsenical-resistance protein  46.18 
 
 
355 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2186  arsenical-resistance protein  44.86 
 
 
349 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368686  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2344  ACR3 permease  45.86 
 
 
363 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7179  arsenical-resistance protein  44.25 
 
 
361 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0958  arsenical resistance protein, putative  46.33 
 
 
356 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3959  arsenical-resistance protein  52.96 
 
 
337 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1963  arsenical-resistance protein  46.18 
 
 
362 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3118  arsenical-resistance protein  47.04 
 
 
342 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1449  bile acid:sodium symporter  45.14 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.939169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4175  arsenical-resistance protein  45.59 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0219012  normal  0.638432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0323  bile acid:sodium symporter  45.88 
 
 
354 aa  289  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0208  arsenical-resistance protein  46.75 
 
 
353 aa  288  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.768524 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1526  bile acid:sodium symporter  44.77 
 
 
354 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0534  arsenical pump membrane protein, putative  52.06 
 
 
339 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4052  arsenical-resistance protein  45.29 
 
 
355 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.815051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0877  arsenical-resistance protein  46.47 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0533  bile acid:sodium symporter  52.92 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3866  arsenical-resistance protein  45.29 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0557  putative arsenical resistance protein  47.32 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171816  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1346  sodium/bile acid symporter family protein  44.15 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.17677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4071  arsenical-resistance protein  45.03 
 
 
350 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0533  bile acid:sodium symporter  53.55 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1426  ACR3 family arsenite transporter  45.53 
 
 
366 aa  282  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.653925  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0565  arsenical-resistance protein  43.81 
 
 
397 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.998655  normal  0.774064 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2038  arsenical-resistance protein  47.92 
 
 
356 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1786  arsenical-resistance protein  46.75 
 
 
357 aa  275  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0258081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>