248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1972 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1972  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 350 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0616  bile acid:sodium symporter  86.99 
 
 		 354 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4071  arsenical-resistance protein  89.14 
 
 		 350 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3126  arsenite efflux pump ACR3  84.59 
 
 		 351 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0323  bile acid:sodium symporter  85.76 
 
 		 354 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3417  bile acid:sodium symporter  91.76 
 
 		 347 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4175  arsenical-resistance protein  82.66 
 
 		 358 aa  542  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0219012  normal  0.638432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4052  arsenical-resistance protein  83.43 
 
 		 355 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3866  arsenical-resistance protein  82.66 
 
 		 358 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1049  arsenical-resistance protein  80.57 
 
 		 355 aa  534  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3959  arsenical-resistance protein  81.95 
 
 		 353 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6065  arsenical pump membrane protein  83.14 
 
 		 364 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0520  arsenical-resistance protein  80.91 
 
 		 351 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0877  arsenical-resistance protein  79.89 
 
 		 351 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1449  bile acid:sodium symporter  79.12 
 
 		 358 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.939169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1786  arsenical-resistance protein  76 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2316  arsenical-resistance protein  75 
 
 		 358 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.460752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1282  arsenical-resistance protein  75.95 
 
 		 358 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0103  arsenical-resistance protein  77.01 
 
 		 350 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0649  arsenical-resistance protein  74.19 
 
 		 348 aa  484  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.045154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2344  ACR3 permease  73.55 
 
 		 363 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0490  arsenical-resistance protein  73.67 
 
 		 361 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1346  sodium/bile acid symporter family protein  74.34 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.17677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30680  arsenical-resistance protein  73.31 
 
 		 357 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0303  arsenite/antimonite exporter, ArsB like  71.1 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00764186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1963  arsenical-resistance protein  73.9 
 
 		 362 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1426  ACR3 family arsenite transporter  74.26 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.653925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0700  bile acid:sodium symporter  72.06 
 
 		 355 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3117  arsenical-resistance protein  71.01 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0330  bile acid:sodium symporter  73.29 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3118  arsenical-resistance protein  73.37 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5378  arsenical-resistance protein  70.75 
 
 		 361 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2186  arsenical-resistance protein  73.08 
 
 		 349 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368686  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1526  bile acid:sodium symporter  73.73 
 
 		 354 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268235  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4214  arsenical-resistance protein  72.83 
 
 		 365 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7179  arsenical-resistance protein  71.51 
 
 		 361 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2517  arsenical-resistance protein  70.89 
 
 		 360 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1343  arsenical-resistance protein  71.18 
 
 		 360 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.198617  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6163  arsenical-resistance protein  73.43 
 
 		 357 aa  454  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.425011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0208  arsenical-resistance protein  72.24 
 
 		 353 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.768524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3825  arsenical-resistance protein  72.49 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.941857  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6328  arsenical-resistance protein  72.78 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.128519  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3663  bile acid:sodium symporter  73.08 
 
 		 355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5672  arsenical-resistance protein  71.89 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2538  bile acid:sodium symporter  74.78 
 
 		 363 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.344052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5599  bile acid:sodium symporter  73.08 
 
 		 368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5709  arsenical-resistance protein  72.43 
 
 		 357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1582  ACR3 permease  73.08 
 
 		 357 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3938  arsenical-resistance protein  72.49 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6563  putative arsenate-sodium symporter  72.84 
 
 		 357 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0958  arsenical resistance protein, putative  71.3 
 
 		 356 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0557  putative arsenical resistance protein  71.01 
 
 		 356 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3196  arsenical-resistance protein  72.54 
 
 		 375 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4964  bile acid:sodium symporter  72.54 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252603  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0457  sodium bile acid symporter family protein  71.3 
 
 		 356 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0579522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0914  putative arsenical resistance protein  71.3 
 
 		 356 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2038  arsenical-resistance protein  71.94 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1943  arsenical-resistance protein  71.3 
 
 		 356 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1883  putative arsenical resistance protein  71.3 
 
 		 356 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5576  putative arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  72.81 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.918672  normal  0.0850565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1518  arsenical-resistance protein  66.27 
 
 		 357 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.894233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1822  putative arsenic resistance protein  56.68 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2834  arsenical-resistance protein  53.78 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  52.72 
 
 		 351 aa  346  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1938  multidrug-efflux transporter  55.43 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6303  arsenical-resistance protein  52.77 
 
 		 344 aa  332  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3640  arsenical-resistance protein  51.79 
 
 		 356 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1853  arsenical-resistance protein  53.56 
 
 		 354 aa  328  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00716983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3442  putative arsenical-resistance protein  50.27 
 
 		 366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3670  arsenical-resistance protein  53.87 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  0.2686 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0652  bile acid:sodium symporter  53.96 
 
 		 357 aa  325  9e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.927211  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3779  arsenical pump membrane protein, putative  52.37 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.567439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4003  bile acid:sodium symporter  53.25 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2589  arsenical-resistance protein  53.41 
 
 		 350 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.441195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3833  arsenical-resistance protein  54.3 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3395  bile acid:sodium symporter  52.57 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0575  arsenical-resistance protein  53.53 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4386  arsenical-resistance protein  52.15 
 
 		 354 aa  317  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3737  arsenical-resistance protein  53.08 
 
 		 345 aa  315  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  46.13 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0534  arsenical pump membrane protein, putative  54.57 
 
 		 339 aa  308  8e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3126  ACR3 family arsenite efflux pump  52.77 
 
 		 350 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3856  arsenical-resistance protein  53.53 
 
 		 350 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2709  bile acid:sodium symporter  50.71 
 
 		 371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0523  bile acid:sodium symporter  51.93 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27289  normal  0.171222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1843  arsenical-resistance protein  51.48 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.172285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3959  arsenical-resistance protein  54.01 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0959  arsenical-resistance protein  50.75 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11311  arsenite efflux pump ACR3  50.15 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0544357 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1100  ACR3 family arsenite transporter  50.9 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1152  arsenical-resistance protein  49.27 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0533  bile acid:sodium symporter  52.52 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1683  arsenical-resistance protein  51.04 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.896768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0533  bile acid:sodium symporter  53.25 
 
 		 339 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1095  arsenite efflux pump  45.83 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000341702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1303  arsenical-resistance protein  46.61 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0334  arsenical-resistance protein  43.2 
 
 		 385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3498  bile acid:sodium symporter  52.96 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0818  hypothetical protein  43.99 
 
 		 352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1111  bile acid:sodium symporter  49.11 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>