239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2603 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 
325 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  74.77 
 
 
331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  71.25 
 
 
515 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  69.97 
 
 
327 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  63.12 
 
 
333 aa  368  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  60.56 
 
 
362 aa  350  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  61.73 
 
 
324 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  58.15 
 
 
323 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  57.19 
 
 
325 aa  338  5e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  57.45 
 
 
334 aa  306  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  37.82 
 
 
315 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  35.03 
 
 
350 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  31.86 
 
 
338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  27.24 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  27.24 
 
 
356 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  26.37 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  24.77 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  24.92 
 
 
351 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  29.15 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.78 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  28.34 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  26.37 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  28.78 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  24.84 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  27.95 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  27.45 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  26.21 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  28.04 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  26.04 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  28.78 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  25.6 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  26.17 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  25.64 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  25.09 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  28.41 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  28.41 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  27.59 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.41 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  26.84 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  26.13 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  26.98 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  25.64 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  26.63 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  24.62 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  24.76 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  25.24 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  25.68 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  25.95 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  25.64 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  25.49 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  24.68 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  25.94 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  25.27 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  25.27 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  25.27 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  25.1 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0212  arsenical-resistance protein  25.87 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0818  hypothetical protein  27.83 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  27.34 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  24.91 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  27.68 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  25.1 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  24.68 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  25.88 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  25.64 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  26.01 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  23.75 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  24.58 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  25.88 
 
 
354 aa  77  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  28.3 
 
 
365 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  24.6 
 
 
368 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  24.63 
 
 
354 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  24.83 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  24.92 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  25.64 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  26.51 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  24.58 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0756  arsenical-resistance protein  28.16 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.442454  hitchhiker  0.00390365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  24.52 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  26.18 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  24.36 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  23.79 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  26.74 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  26.44 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31170  arsenical-resistance protein  24.71 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  24.07 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  26.95 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  26.69 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  26.07 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  24.43 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  24.68 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  25.57 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4522  arsenical-resistance protein  26.26 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1095  arsenite efflux pump  25.86 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000341702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4609  arsenical-resistance protein  26.26 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4905  arsenical-resistance protein  26.26 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  24.92 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  23.85 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  23.85 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>