120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0196 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 323 aa  585  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  79.17 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  79.41 
 
 		 316 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  79.17 
 
 		 331 aa  299  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  61.18 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  61.18 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  61.18 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  54.92 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  40.72 
 
 		 329 aa  225  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  53.97 
 
 		 336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  43.18 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  49.84 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  44.13 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  45.37 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  44.59 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  51.46 
 
 		 345 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  44.52 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  44.59 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  44.24 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  43.87 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  44.27 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  59.13 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  45.37 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  60.07 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  42.72 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  43.48 
 
 		 325 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  44.41 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  45.88 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  41.23 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  42.77 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  54.8 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  42.51 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  42.51 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  35.99 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  31.8 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  31.25 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  30.92 
 
 		 321 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  30.59 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  30.59 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  30.59 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  30.26 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  30.92 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  30.26 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  30.26 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  37.86 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  39.3 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  28.87 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  54.17 
 
 		 255 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  40.74 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  36.75 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  24.32 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  26.16 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  25.72 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  27.41 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  27.27 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  25.22 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  24.78 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  37.07 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  23.49 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  25.23 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  22.73 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  24.92 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  22.63 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  25.31 
 
 		 354 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  23.9 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3465  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  28.99 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  23.45 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  23.13 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  25.96 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  29.71 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  24.48 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  25.77 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  22.97 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  20.49 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  29.14 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  26.32 
 
 		 358 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  23.32 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  21.64 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  25.15 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  22.88 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  21.64 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  21.64 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  22.01 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  21.64 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  25.98 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  21.98 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  29.41 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  21.64 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  21.64 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  21.27 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  22.93 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  27.55 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  25.61 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6114  arsenical-resistance protein  23.45 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  25.66 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  25.84 
 
 		 378 aa  46.2  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  24.77 
 
 		 355 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  27.95 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  28.2 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>