162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4299 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 331 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 331 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 331 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  62.86 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  57.42 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  43.75 
 
 		 329 aa  245  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  54.78 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  62.46 
 
 		 316 aa  228  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  49.22 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  43.13 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  61.46 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  51.71 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  45.48 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  40.85 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  61.18 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  59.01 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  43.45 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  47.1 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  42.54 
 
 		 325 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  41.96 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  47.28 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  39.81 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  43.09 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  43.4 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  44.16 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  55.03 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  43.67 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  48.24 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  43.45 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  55.21 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  41.07 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  39.17 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  36.89 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  40 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  40 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.88 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.21 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  28.53 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.59 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.59 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  27.59 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.9 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  27.59 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  27.38 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.15 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  37.99 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  26.69 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  40.68 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  54.36 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  25.93 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  27.33 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  26.41 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  31.33 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  30 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  40.68 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  27.05 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  26.9 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  26.9 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  25.86 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1810  arsenical-resistance protein  26.36 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324178  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  28.08 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  25.95 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  29.91 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3445  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  30.56 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  29.85 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  25.44 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  27.74 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  26.02 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  26.3 
 
 		 328 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  24.18 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  30.25 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  24.55 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  27.05 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  24.69 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  27.66 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  29.61 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  24.85 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  29.5 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  26.47 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  25.75 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  25.15 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  24.93 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  25.07 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  38.05 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  30.63 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  26.13 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  25.75 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  24.1 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  24.85 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  28.71 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  25.15 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  24.63 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  24.38 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  24.63 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  29.46 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  24.63 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  24.34 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  24.69 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  21.9 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>