57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3638 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 326 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  62.62 
 
 		 322 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  59.81 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  62.62 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  61.8 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  55.91 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  54.78 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  54.9 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  54.55 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  41.61 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  45.02 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  44.41 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  45.28 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  42.04 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  48.31 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  44.44 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  45.05 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  48.51 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  43.4 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  43.4 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  43.4 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  44.44 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  40.5 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  43 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  40 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  50 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  51.1 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  44.41 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  42 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  42 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  46.23 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  45.75 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43.56 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  38.36 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  44.24 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  26.77 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.18 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  26.95 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  26.95 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  26.47 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  34.87 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  26.62 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  25.97 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  26.45 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  26.45 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  25.97 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  31.01 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  44.74 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  30.03 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  31.38 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  27.12 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  23.17 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  33.33 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  27.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  23.81 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  28.15 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  26.83 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>