94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5425 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 345 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  71.25 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  60.25 
 
 		 336 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  57.91 
 
 		 342 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  48.06 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  49.68 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  43.91 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  49.19 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  53.8 
 
 		 326 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  47.6 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  51.71 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  51.71 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  51.71 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  50.49 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  62.94 
 
 		 311 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  52.29 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  46.28 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  44.66 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  55.87 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  42.81 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  45.31 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  46.18 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  52.41 
 
 		 316 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  42.68 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  43.41 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  54.21 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  40.58 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  44.05 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  41.35 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  50.31 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  41.51 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  38.46 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  42.63 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  41.46 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  40 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  40 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.37 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  28.03 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  28.03 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  27.68 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  28.37 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  28.03 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.68 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  28.03 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  27.68 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.68 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  52.08 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  31.77 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  30.67 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  23.68 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  31.09 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  29.04 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  29.29 
 
 		 367 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  34.83 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  30 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  24.9 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  29.93 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  31.72 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  32.41 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  35.1 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  27.36 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  28 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  31.37 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  25.95 
 
 		 352 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  32.03 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  31.67 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  30.22 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  25.84 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  29.11 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2651  hypothetical protein  61.36 
 
 		 73 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  26.46 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  33.05 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  25.76 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  28.1 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  28.1 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  30.77 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  27.66 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  30.36 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  34.03 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  25.84 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  26.67 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  27.14 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  25.83 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  27.08 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  27.59 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  33.06 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  34 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  34.03 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  28.36 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  27.09 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  27.82 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1442  arsenical-resistance protein  27.91 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  26.22 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  27.27 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>