112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5580 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  100 
 
 		 320 aa  617  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  73.42 
 
 		 317 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  73.42 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  72.47 
 
 		 317 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  71.16 
 
 		 325 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  74.05 
 
 		 317 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  85.92 
 
 		 247 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  85.92 
 
 		 247 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  46.65 
 
 		 329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  48.23 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  48.24 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  49.52 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  44.59 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  48.71 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  44.44 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  44.09 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  44.84 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  43.67 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  43.67 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  43.67 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  42.01 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  44.73 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  38.68 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  42.39 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  44.37 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  45.05 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  35.65 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  43 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  37.42 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  42.72 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  31.68 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  36.57 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  31.73 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  31.73 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  31.73 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  31.37 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  31.73 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  31.37 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  31.37 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  43.87 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  31 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  30.69 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  42.77 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  41.22 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  34.07 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  39.5 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  30.43 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  40.82 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  36.36 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  28.32 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  25.5 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  21.92 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  21.96 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  27.78 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  23.23 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  22.8 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  25.81 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  24.38 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  20 
 
 		 362 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  21.97 
 
 		 381 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  25.52 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  21.85 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  24.22 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  23.75 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  21.5 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  21.97 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  23.4 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  22.18 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  24.34 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  50.56 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  21.8 
 
 		 381 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  26.83 
 
 		 358 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  22 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  20.34 
 
 		 354 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  24.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  26.47 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  19.73 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  22 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  21.43 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  21.4 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  23.4 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  26.83 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  25.71 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  23.64 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  22.07 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  21.38 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  20.96 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  24.59 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  26.47 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  27.52 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  25.55 
 
 		 377 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  24.29 
 
 		 351 aa  45.8  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  27.45 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  25 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  27.83 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  24.39 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  23.81 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  21.43 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  21.43 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>